大规模推进农村建设用地综合整治，既是新形势下缓解土地资源供需矛盾、加强耕地保护、促进城乡统筹发展的一项创新之举，也是农村农业发展方式的重大转变。农村土地综合整治事关长远、牵动全局，涉及千家万户长远生计，只有拓宽视野、整体谋划、创新思路、统筹推进，才能实现“政府得土地、农民得实惠、城乡得发展”的多赢效应。
一要突出规划引领作用。土地综合整治不是单一的土地整理，而是包括田、水、路、林、村在内的全域整治，需要在全域规划、全域设计的基础上统筹推进。推进农村土地综合整治，必须坚持规划先行，综合考虑田、水、路、林、村优化布局和现代农业建设，统筹土地利用、村庄建设、基础设施、产业发展、生态环境、社会事业等，注重保持农村风貌和当地特色，保留传统的农耕文化和民俗文化的积极元素，建设与城镇同样便利而风貌有别的现代农村。
二要强化资金整合效益。按照现有政策，可以整合五个方面的资金来投入土地综合整治。一是土地整理开发专项资金，包括新增建设用地有偿使用费、耕地开垦费、土地复垦费、土地出让金等用于农业土地开发部分。二是城乡建设用地增减挂钩增值收益。三是各类涉农资金。四是社会资金。五是财税和金融支持。
三要做好多项结合文章。重点抓好三个结合：
一是土地综合整治与新农村建设相结合。按照新农村建设的要求，着力加强土地整理，集中连片推进土地平整和农田水利、田间道路、田间防护林等建设，切实提高农业综合生产能力；
着力推进村庄整治，切实优化城乡用地结构，形成居住相对集中、产业集聚发展的新农村格局；
着力抓好设施配套，实现布局优化、道路硬化、村庄绿化、环境美化，切实改善人居环境；
着力发展现代农业，提高农业产业化水平，促进农业增效、农民增收，最终实现“生产发展、生活宽裕、乡风文明、村容整洁、管理民主”的目标。
二是土地综合整治与城乡建设用地增减挂钩相结合。要在整治区全面实行城乡建设用地增减挂钩，对项目区原有建设用地整理复垦后形成的建设用地置换指标，优先保证农民宅基地、农村基础设施和公共服务实施建设，并为当地农村集体经济发展留足空间，富余部分可以用于城乡用地增减挂钩，调剂到城市建设发展。
三是土地综合整治与承包经营权流转相结合。按照依法、自愿、有偿的原则，在坚持不改变土地集体所有制性质、不改变土地用途、不损害农民土地承包权益的前提下，鼓励城乡各类经营主体以转包、出租、互换、转让、股份合作及联耕联种联营等形式，引导土地向规模经营大户集中。
四要积极探索机制创新。
一是创新项目实施方式。各级政府成立土地综合整治工作领导小组，主要负责项目审查审批和统筹调度，国土资源等相关部门组建相应工作机构，负责具体项目的督查实施，构建“政府主导、国土搭台、各方唱戏、群众参与”的工作格局。
二是创新资金投入方式。对经济欠发达地区和耕地整治潜力大的地区，仍然实行财政为主的投入方式。对经济较发达地区和社会投资活跃的地区，推行“以补代投”，引导社会各类资金流向农村参与土地综合整治，构建以企业投资为主体、财政补助引导相结合的投资方式。
三是创新耕地管理方式。及时将新增耕地发包给承包经营大户，颁发承包经营权证，设立项目区耕地后期管护资金，对经营大户在一定年限内耕种新开垦耕地给予适当补贴，有效调动经营大户耕作新增耕地的积极性和主动性。
五要维护群众合法权益。要充分体现群众意愿，对运作模式、规划设计、耕地整理、旧房改造、新居建设和社会保障等各方面，全程吸收群众代表参与，通过公告、听证、公示、票决等方式，广泛征求村民组织和农民对土地整治的意见，并依法签订协议，每个项目必须得到三分之二以上的群众赞成才能实施。要积极帮助群众增收，想方设法创造条件，让当地农民在参与土地整治工程建设中获得劳务收入，使农民获得稳定的“田租”收入。通过促进结构调整，提高土地综合效益，促进农民通过发展现代农业实现增收，切实维护群众合法权益。
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